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希尔达
DOI:10.18129 / B9.bioc.HiLDA
此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见希尔达．
利用分层潜狄利克雷分配对突变特征的突变暴露进行统计推断
Bioconductor版本:3.10
在贝叶斯框架下构建的包，应用分层潜狄利克雷分配来统计测试突变特征(白石模型特征)的突变暴露在两组之间是否不同。
作者:杨智[aut, cre]，白石雄一[ctb]
维护人员:zhiyang
引文(从R内，输入引用(“希尔达”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("HiLDA")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“希尔达”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | HiLDA的介绍 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 安装 |
细节
| biocViews | 贝叶斯，测序，软件，SomaticMutation，StatisticalMethod |
| 版本 | 1.0.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.10 (R-3.6)(< 6个月) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 3.6)，ggplot2 |
| 进口 | R2jags，abind，cowplot、网格forcats，stringr，GenomicRanges，S4Vectors，XVector，Biostrings，GenomicFeatures，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，BiocGenerics，tidyr， grDevices, stats，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene， utils，方法，Rcpp |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | knitr，rmarkdown，testthat，BiocStyle |
| SystemRequirements | 缺口4.2.0 |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/USCbiostats/HiLDAhttps://doi.org/10.1101/577452 |
| BugReports | https://github.com/USCbiostats/HiLDA/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | HiLDA_1.0.0.tar.gz |
| Windows二进制 | HiLDA_1.0.0.zip |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | HiLDA_1.0.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HiLDA |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HiLDA |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/HiLDA/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
