哈曼
DOI:10.18129 / B9.bioc.Harman
这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅哈曼。
批处理效果的去除数据集使用基于PCA和约束优化技术
Bioconductor版本:3.10
哈曼是一个基于PCA和约束优化技术,最大化的批处理从数据集的影响,与约束过校正的概率(即消除真正的生物信号以及批处理噪声)是由最终用户设置的一小部分。
作者:乔希·鲍登(aut),詹森•罗斯(aut (cre) Yalchin Oytam (aut)
维修工:杰森·罗斯<杰森。罗斯在csiro.au >
从内部引用(R,回车引用(“哈曼”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“哈曼”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
哈曼browseVignettes (“”)
| HTML | R脚本 | IntroductionToHarman |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | BatchEffect,DNAMethylation,微阵列,MultipleComparison,归一化,预处理,PrincipalComponent,软件,StatisticalMethod,转录 |
| 版本 | 1.14.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.3 (r - 3.3)(4年) |
| 许可证 | GPL-3 +文件许可证 |
| 取决于 | R (> = 3.5) |
| 进口 | Rcpp(> = 0.11.2)、图形、统计数据 |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | HarmanData,BiocGenerics,BiocStyle,knitr,rmarkdown,RUnit,RColorBrewer,bladderbatch,limma,minfi,光民,msmsEDA,affydata,minfiData,股东价值分析 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://www.bioinformatics.csiro.au/harman/ |
| BugReports | https://github.com/JasonR055/Harman/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | debrowser |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | Harman_1.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Harman_1.14.0.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | Harman_1.14.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Harman |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/哈曼 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Harman/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
