HTqPCR

DOI:10.18129 / B9.bioc.HTqPCR

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见HTqPCR．

自动分析高通量qPCR数据

Bioconductor版本:3.10

在多个条件或重复的高通量定量实时PCR (qPCR)分析Ct值。输入数据可以来自空间定义的格式，如ABI TaqMan低密度阵列或OpenArray;Roche应用科学公司的LightCycler;Bio-Rad实验室的CFX板;常规96孔或384孔板;或者微流控设备，如Fluidigm公司的动态阵列。HTqPCR处理数据加载、质量评估、归一化、可视化和参数或非参数测试，以确定特征(如基因、microRNAs)之间Ct值的统计显著性。

作者:Heidi Dvinge, Paul Bertone

维护:Heidi Dvinge

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("HTqPCR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“HTqPCR”)

PDF	R脚本	qPCR分析R
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，DifferentialExpression，GeneExpression，MicrotitrePlateAssay，MultipleComparison，预处理，质量控制，软件，可视化，qPCR
版本	1.40.0
在Bioconductor	BioC 2.5 (R-2.10)(10.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	Biobase，RColorBrewer，limma
进口	affy，Biobase，gplots，图形，grDevices，limma、方法、RColorBrewer， stats, stats4, utils
链接
建议	statmod
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.ebi.ac.uk/bertone/software
全靠我
进口我	nondetects，unifiedWMWqPCR
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	HTqPCR_1.40.0.tar.gz
Windows二进制	HTqPCR_1.40.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	HTqPCR_1.40.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HTqPCR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HTqPCR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/HTqPCR/
软件包下载报告	下载数据