HTSFilter

DOI:10.18129 / B9.bioc.HTSFilter

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅HTSFilter。

过滤器复制高通量转录组测序数据

Bioconductor版本:3.10

这个方案实现了一个过滤程序复制转录组测序数据基于全球Jaccard相似性指数,以确定较低的基因,常数的表达水平在一个或多个实验条件。

作者:安德里亚劳梅丽娜Gallopin, Gilles Celeux,佛罗伦萨Jaffrezic

维护人员:安德里亚劳<安德里亚。劳在inra.fr >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“HTSFilter”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“HTSFilter”)

PDF	R脚本	HTSFilter装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,ImmunoOncology,归一化,预处理,RNASeq,测序,软件
版本	1.26.0
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(7年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.4)
进口	刨边机(> = 3.9.14),DESeq2(> = 1.10.1),DESeq(> = 1.22.1),BiocParallel(> = 3),Biobase跑龙套,统计grDevices、图形的方法
链接
建议	EDASeq(> = 2.1.4),BiocStyle,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	coseq
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	HTSFilter_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	HTSFilter_1.26.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	HTSFilter_1.26.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HTSFilter
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ HTSFilter
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/HTSFilter/
包下载报告	下载数据