HPAanalyze

DOI:10.18129 / B9.bioc.HPAanalyze

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅HPAanalyze。

从人类的蛋白质图谱检索和分析数据

Bioconductor版本:3.10

提供检索功能,探索人类蛋白质图谱数据分析和可视化。

作者:安一Tran (aut (cre)

维护人员:安一Tran < trannhatanh89 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“HPAanalyze”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“HPAanalyze”)

HTML	R脚本	1。HPAanalyze快速入门指南:获取和可视化的人类蛋白质图谱(HPA)数据在一个函数
HTML	R脚本	2。HPAanalyze深入:处理人类蛋白质图谱(HPA)数据在R
HTML	R脚本	3所示。HPAanalyze用例:结合你的人类蛋白质图谱(HPA)查询
HTML	R脚本	4所示。HPAanalyze用例:与人类蛋白质图谱(HPA)的xml文件离线
HTML	R脚本	5。HPAanalyze用例:出口人类蛋白质图谱(HPA)数据为JSON
HTML	R脚本	6。HPAanalyze用例:下载组织学图像从人类蛋白质图谱
HTML	R脚本	99年。代码的数据HPAanalyze纸
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	CellBiology,蛋白质组学,软件,可视化
版本	3
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(1.5年)
许可证	GPL-3 +文件许可证
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	dplyr,openxlsx,ggplot2,宠物猫,xml2,统计,跑龙套,gridExtra
链接
建议	knitr,rmarkdown,devtools,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	HPAanalyze_1.4.3.tar.gz
Windows二进制	HPAanalyze_1.4.3.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	HPAanalyze_1.4.3.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HPAanalyze
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ HPAanalyze
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/HPAanalyze/
包下载报告	下载数据