HDF5Array

doi：10.18129/b9.bioc.hdf5array

此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅HDF5Array。

HDF5后端用于延迟的对象

生物导体版本：3.10

实现HDF5Array和Tenxmatrix类，2个方便且内存效率的类似阵列的容器，用于HDF5数据集的盘表示。HDF5Array适用于使用常规（即密度）HDF5表示的数据集。Tenxmatrix用于使用10倍基因组学（例如130万个脑细胞数据集）的基于HDF5的稀疏基质表示的数据集。这两个容器都是延迟的扩展，它们都支持延迟的对象支持的所有操作。这些操作可以延迟或进行阻止处理。

作者：HervéPagès

维护者：fredhutch.org上的hervépagès

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ hdf5array”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	注解，，，，覆盖范围，，，，DataImport，，，，datarepresentation，，，，基因数，，，，免疫学，，，，基础设施，，，，rnaseq，，，，测序，，，，Singlecell，，，，软件
版本	1.14.4
在生物导体中	Bioc 3.3（R-3.3）（4年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 3.4），方法，延迟（> = 0.12.3），RHDF5（> = 2.30.1）
进口	UTIT，工具，矩阵，，，，生物基因（> = 0.32.0），S4VECTORS，，，，iranges
链接	S4VECTORS（> = 0.24.4），Rhdf5lib
建议	H5VCDATA，，，，总结性特征（> = 1.15.1），基因组机，，，，实验室，，，，tenxbraindata，，，，生物比较，，，，GenomicFeatures，，，，生物使用
系统要求	gnu做
增强
URL
取决于我	Genogam，，，，tenxbraindata，，，，tenxpbmcdata
进口我	饼干，，，，BSSEQ，，，，簇发酵，，，，策展，，，，延迟的matrixstats，，，，液滴，，，，HCADATA，，，，loomexpermiment，，，，Methrix，，，，Minfi，，，，NetSmooth，，，，Scmeth，，，，SignaturesEarch
建议我	Biocsklearn，，，，延迟，，，，桅杆，，，，mbkmeans，，，，多亚sayExexperiment，，，，Scmerge，，，，斯克兰，，，，总结性特征
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	hdf5array_1.14.4.4.tar.gz
Windows二进制	hdf5array_1.14.4.4.zip（32-和64位）
Mac OS X 10.11（El Capitan）	hdf5array_1.14.4.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hdf5array
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/hdf5array
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/hdf5array/
软件包下载报告	下载统计