Greylistchip
doi：10.18129/b9.bioc.greylistchip
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅Greylistchip。
灰色列表 - 基于芯片输入的面具人工制品区域
生物导体版本：3.10
识别输入中具有高信号的芯片实验区域，这会导致峰值呼叫期间杂散的峰值。删除在峰值通话之前与这些区域保持一致的读取，以进行清洁芯片分析。
作者：Gord Brown
维护者：Gordon Brown
引用（从r内，输入引用（“ Greylistchip”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ greylistchip”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Greylistchip”）
| R脚本 | 从输入库生成灰色列表 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 结盟，，，，chipseq，，，，覆盖范围，，，，差异词，，，，基因数，，，，预处理，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.18.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.1（R-3.2）（5年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | R（> = 3.5），方法，基因组机 |
| 进口 | 基因组签名，，，，BSGENOME，，，，rsamtools，，，，rtracklayer，，，，大量的， 平行，GenomeInfodB，，，，总结性特征，统计，utils |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，生物基因，，，，运行 |
| 系统要求 | |
| 增强 | bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19 |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | GreylistChip_1.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | GreyListChip_1.18.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | GreylistChip_1.18.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/greylistchip |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/greylistchip |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/greylistchip/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
