此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅基因组机。
生物导体版本:3.10
在分析高通量测序数据(又称NGS数据)时,有效表示和操纵基因组注释和比对的能力正在发挥核心作用。Genomicranges软件包定义了用于存储和操纵基因组定义的基因组间隔和变量的通用容器。分别在基因组签名和摘要套件中定义了更专业的容器,用于代表和操纵针对参考基因组或实验的基质样摘要的简短对齐。这两个软件包都建立在基因组基础架构之上。
作者:P。Aboyoun,H。Pagès和M. Lawrence
维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
引用(从r内,输入引用(“基因组”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ genomicranges”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“基因组旋翼”)
html | R脚本 | 1.基因组包装的简介 |
R脚本 | 2. Genomicranges Howtos | |
R脚本 | 3.快速介绍Granges和GrangeSlist对象(幻灯片) | |
R脚本 | 4.您不知道的十件事(Bioc 2016年幻灯片) | |
R脚本 | 5.扩展基因组 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Genomicranges_1.38.0.tar.gz |
Windows二进制 | genomicranges_1.38.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | Genomicranges_1.38.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genomicranges |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/基因组机器人 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/genomicranges/ |
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