Genomicozone

doi：10.18129/b9.bioc.genomicozone

此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅Genomicozone。

描述差异基因活性的杰出基因组区

生物导体版本：3.10

该包装将沿染色体的基因活性簇成区域，检测到差异区域为杰出区域，并可视化整个基因组中杰出区域的地图。该方法保证群集最优性，线性运行时到样本量和可重复性。它可以通过基因组重组，结构变异和表观基因组改变引起的效果的新表征。

作者：惠祖（Mingzhou）歌曲

维护者：hua zhong

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ genomicozone”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Genomicozone”）

html	R脚本	Genomicozone
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	注解，，，，生物医学信息学，，，，细胞生物学，，，，聚类，，，，覆盖范围，，，，差异性，，，，差甲基化，，，，功能基因组学，，，，功能性预测，，，，基因表达，，，，结肠管制，，，，遗传学，，，，基因组变量，，，，rnaseq，，，，回归，，，，测序，，，，软件，，，，结构变化，，，，系统生物学，，，，转录，，，，转录组学，，，，可视化
版本	1.0.0
在生物导体中	Bioc 3.10（R-3.6）（<6个月）
执照	LGPL（> = 3）
要看	r（> = 3.6），ckmeans.1d.dp（> = 4.3.0），基因组机，，，，Biomart，，，，GGPLOT2
进口	grdevices，统计，utils，plyr，，，，栅格，，，，SJSTATS， 平行，GGBIO，，，，S4VECTORS，，，，iranges，，，，GenomeInfodB，，，，rdpack
链接
建议	readxl，，，，地球，，，，尼特，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Genomicozone_1.0.0.0.tar.gz
Windows二进制	Genomicozone_1.0.0.0.zip
Mac OS X 10.11（El Capitan）	Genomicozone_1.0.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genomicozone
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/genomicozone
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/genomicozone/
软件包下载报告	下载统计