基因组

doi：10.18129/b9.bioc.genomegraphs

这个包是弃用。它可能会从生物导体中取出。请参考包装终止指南了解更多信息。

此软件包适用于生物导体的3.10版。该软件包已从生物导体中删除。有关最后一个稳定的最新版本版本，请参阅基因组。

从Ensembl绘制基因组信息

生物导体版本：3.10

基因组数据分析需要对已知基因组信息和新实验数据的整合可视化。GenomeGraphs使用BiomArt软件包执行实时注释查询以结合并将其转换为例如网格图形包的视口中的基因/转录结构。这导致基因组信息与您的数据一起绘制。基因组图的另一个优势是绘制不同的数据类型，例如阵列CGH，基因表达，测序和其他数据，并在一个图中使用相同的基因组坐标系一起在一个图中共同绘制。

作者：steffen durinck ，詹姆斯·布拉德（James Bullard）的布拉德>

维护者：steffen durinck

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ GenomeGraphs”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ GenomeGraphs”）

PDF	R脚本	GenomeGraphs用户指南
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	微阵列，，，，软件，，，，可视化
版本	1.46.0
在生物导体中	Bioc 2.2（R-2.7）（12年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 2.10），方法，Biomart， 网格
进口
链接
建议
系统要求
增强
URL
取决于我	Genominator，，，，波动
进口我
建议我	Leebamviews，，，，奥利戈，，，，奥利戈
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	GenomeGraphs_1.46.0.tar.gz
Windows二进制	GenomeGraphs_1.46.0.zip（32-和64位）
Mac OS X 10.11（El Capitan）	GenomeGraphs_1.46.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genomegraphs
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/GenomeGraphs
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/genomegraphs/
软件包下载报告	下载统计