此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GeneStructureTools.
Bioconductor版本:3.10
GeneStructureTools可用于在硅片中创建替代剪接事件,并分析这对功能基因产品的潜在影响。
作者:Beth Signal
维护者:Beth信号
引文(从R内,输入引用(“GeneStructureTools”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("GeneStructureTools")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“GeneStructureTools”)
超文本标记语言 | R脚本 | GeneStructureTools简介 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | AlternativeSplicing,DifferentialSplicing,FunctionalPrediction,ImmunoOncology,RNASeq,软件,转录组 |
版本 | 1.6.0 |
在Bioconductor | BioC 3.7 (R-3.5)(2年) |
许可证 | BSD_3_clause +文件许可证 |
取决于 | |
进口 | Biostrings,GenomicRanges,IRanges,data.table,plyr,stringdist,stringr,S4Vectors,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10,统计,utils,Gviz,rtracklayer、方法 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | GeneStructureTools_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | GeneStructureTools_1.6.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | GeneStructureTools_1.6.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GeneStructureTools |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GeneStructureTools |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GeneStructureTools/ |
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