GRridge

DOI:10.18129 / B9.bioc.GRridge

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见GRridge．

利用协同数据更好的预测:自适应组正则化岭回归

Bioconductor版本:3.10

该软件包允许使用多个协同数据来源(例如外部p值、基因列表、注释)，以使用(逻辑、线性或Cox)组正则化脊回归来改进二元、连续和生存响应的预测。它还通过使用ROC曲线和AUC进行交叉验证，便于事后变量选择和预测诊断。

作者:Mark A. van de Wiel < Mark。Vdwiel at vumc.nl>，Putri W. Novianti

维护者:Mark A. van de Wiel < Mark。Vdwiel at vumc.nl>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GRridge")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“GRridge”)

PDF	R脚本	GRridge
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	贝叶斯，分类，去，GeneExpression，GenePrediction，GeneSetEnrichment，GraphAndNetwork，ImmunoOncology，KEGG，通路，RNASeq，回归，软件，生存
版本	1.10.0
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(3年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.2)，处罚，Iso，生存、方法、图统计数据,glmnet，mvtnorm
进口
链接
建议	testthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	GRridge_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	GRridge_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	GRridge_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GRridge
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GRridge
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GRridge/
软件包下载报告	下载数据