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GOsummaries
DOI:10.18129 / B9.bioc.GOsummaries
这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GOsummaries。
词云去富集分析的总结
Bioconductor版本:3.10
包想象基因本体论(去)浓缩等不同引起的基因列表分析分析结果聚类和主成分分析。重要的类别是视觉词云,可以结合不同的情节总结底层数据。
作者:Raivo Kolde < Raivo。在eesti.ee kolde >
维护人员:Raivo Kolde < Raivo。在eesti.ee kolde >
从内部引用(R,回车引用(“GOsummaries”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GOsummaries”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“GOsummaries”)
| R脚本 | GOsummaries基础知识 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 聚类,去,GeneExpression,软件,可视化 |
| 版本 | 2.22.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.0 (r - 3.1)(5.5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 2.15),Rcpp |
| 进口 | plyr、网格gProfileR,reshape2,limma,ggplot2,gtable |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | 素食主义者 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/raivokolde/GOsummaries |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | GOsummaries_2.22.0.tar.gz |
| Windows二进制 | GOsummaries_2.22.0.zip(32位和64位) |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | GOsummaries_2.22.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GOsummaries |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GOsummaries |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GOsummaries/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
