GNET2

DOI:10.18129 / B9.bioc.GNET2

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GNET2。

通过功能模块构建基因调控网络的表达数据推理

Bioconductor版本:3.10

集群基因与e m官能团的过程。迭代执行TF分配和基因分配,直到基因的分配没有变化,或达到最大迭代次数。

作者:陈Chen杰侯和王健林程艘

维护人员:陈陈< ccm3x mail.missouri.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GNET2”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GNET2”)

HTML	R脚本	构建功能基因与GNET2模块
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,网络,NetworkInference,回归,软件
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(1年)
许可证	Apache 2.0许可
取决于	R (> = 3.6)
进口	ggplot2,xgboost,Rcpp,reshape2、网格图、方法、统计数据matrixStats、图形、SummarizedExperiment
链接	Rcpp
建议	knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/chrischen1/GNET2
BugReports	https://github.com/chrischen1/GNET2/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	GNET2_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	GNET2_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	GNET2_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GNET2
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GNET2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GNET2/
包下载报告	下载数据