GGtools

DOI:10.18129 / B9.bioc.GGtools

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见GGtools．

基因表达遗传学分析软件和数据

Bioconductor版本:3.10

用于基因表达和/或DNA甲基化遗传学分析的软件和数据

作者:VJ Carey

维护者:VJ Carey

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GGtools")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“GGtools”)

PDF	R脚本	GGtools: eQTL鉴定软件
PDF		参考手册
文本		自述
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，GeneticVariability，遗传学，单核苷酸多态性，软件
版本	5.22.0
在Bioconductor	BioC 1.9 (R-2.4)(13.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 2.14)，GGBase(> = 3.19.7),data.table平行,Homo.sapiens
进口	方法，utils，统计，BiocGenerics(> = 0.25.1),snpStats，ff，Rsamtools，AnnotationDbi，Biobase，位，VariantAnnotation，hexbin，rtracklayer，Gvizstats4,S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges，GenomeInfoDb，GenomicRanges(> = 1.29.6),迭代器，Biostrings，ROCR，biglm，ggplot2，reshape2
链接
建议	GGdata，illuminaHumanv1.db，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37，乘，大气气溶胶，rmeta
SystemRequirements
增强了	MatrixEQTL，foreach，doParallel，gwascat
URL
全靠我	ceu1kg，eQTL
进口我	ceuhm3，GeneGeneInteR
建议我	cgdv17，dsQTL，GGBase，gQTLBase，hmyriB36
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	GGtools_5.22.0.tar.gz
Windows二进制	GGtools_5.22.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	GGtools_5.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GGtools
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GGtools
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GGtools/
软件包下载报告	下载数据