此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅ga4ghshiny。
生物导体版本:3.10
GA4GHSHINY软件包提供了一种基于全球基因组学和健康联盟(GA4GH)基因组学API与数据服务器进行交互的简便方法。它还与信标网络集成。
作者:Welliton Souza [AUT,CRE],Benilton Carvalho [CTB],Cristiane Rocha [CTB],Elizabeth Borgognoni [CTB]
维护者:welliton souza
引用(从r内,输入引用(“ ga4ghshiny”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ ga4ghshiny”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Ga4ghshiny”)
html | R脚本 | ga4ghshiny |
参考手册 |
生物浏览 | GUI,,,,软件 |
版本 | 1.8.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.6(R-3.4)(2。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | ga4ghclient |
进口 | AnnotationDbi,,,,生物基因,,,,dplyr,,,,DT,,,,GenomeInfodB,,,,OpenXLSX,,,,GenomicFeatures, 方法,purrr,,,,S4VECTORS,,,,闪亮的,,,,Shinyjs,,,,花花公子,,,,有光泽的人 |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,org.hs.eg.db,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/labbcb/ga4ghshiny |
BugReports | https://github.com/labbcb/ga4ghshiny/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | ga4ghshiny_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | ga4ghshiny_1.8.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | ga4ghshiny_1.8.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ga4ghshiny |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/ga4ghshiny |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/ga4ghshiny/ |
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