GA4GHclient

DOI:10.18129 / B9.bioc.GA4GHclient

此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见GA4GHclient．

用于访问GA4GH API数据服务器的Bioconductor包

Bioconductor版本:3.10

GA4GHclient通过全球基因组学和健康联盟(GA4GH)基因组学API提供了一种访问公共数据服务器的简单方法。它提供对GA4GH API的低级访问，并将响应数据转换为基于bioconductor的类对象。

作者:Welliton Souza [aut, cre]， Benilton Carvalho [ctb]， Cristiane Rocha [ctb]

维护:Welliton Souza

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“GA4GHclient”)

超文本标记语言	R脚本	GA4GHclient
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataRepresentation，软件，ThirdPartyClient
版本	1.10.0
在Bioconductor公司	BioC 3.5 (R-3.4)(3年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	S4Vectors
进口	BiocGenerics，Biostrings，dplyr，GenomeInfoDb，GenomicRanges，httr，IRanges，jsonlite、方法、VariantAnnotation
链接
建议	AnnotationDbi，BiocStyle，DT，knitr，org.Hs.eg.db，rmarkdown，testthat，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/labbcb/GA4GHclient
BugReports	https://github.com/labbcb/GA4GHclient/issues
全靠我	GA4GHshiny
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	GA4GHclient_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	GA4GHclient_1.10.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	GA4GHclient_1.10.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/GA4GHclient
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GA4GHclient
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GA4GHclient/
软件包下载报告	下载数据