流动

doi:10.18129/b9.bioc.flowsom

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅流动

使用自组织地图可视化和解释细胞术数据

生物导体版本:3.10

Flowsom通过使用自组织的地图聚类和最小的跨越树提供可视化选项,以提供细胞术数据的可视化选项。

作者:Sofie Van Gassen [AUT,CRE],Britt Callebaut [AUT],Yvan Saeys [aut]

维护者:sofie van gassen

引用(从r内,输入引用(“流”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ flowsom”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“流”)

PDF R脚本 流动
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 蜂窝基,,,,细胞生物学,,,,聚类,,,,流程仪,,,,软件,,,,可视化
版本 1.18.0
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 3.6),Igraph
进口 统计,utils,流核,,,,共识ClusterPlus,,,,生物基因,,,,tsne,,,,FlowWorkspace,,,,细胞瘤,,,,XML,,,,rcolorbrewer
链接
建议 生物使用
系统要求
增强
URL http://www.r-project.orghttp://dambi.ugent.be
取决于我
进口我 催化剂,,,,胞胎,,,,diffcyt,,,,flowspy,,,,Metacyto
建议我 hdcytodata
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 flowsom_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 flowsom_1.18.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) flowsom_1.18.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowsom
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/流量
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/flowsom/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网