此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅流动。
生物导体版本:3.10
Flowsom通过使用自组织的地图聚类和最小的跨越树提供可视化选项,以提供细胞术数据的可视化选项。
作者:Sofie Van Gassen [AUT,CRE],Britt Callebaut [AUT],Yvan Saeys [aut]
维护者:sofie van gassen
引用(从r内,输入引用(“流”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ flowsom”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“流”)
R脚本 | 流动 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 蜂窝基,,,,细胞生物学,,,,聚类,,,,流程仪,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.18.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.1(R-3.2)(5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 3.6),Igraph |
进口 | 统计,utils,流核,,,,共识ClusterPlus,,,,生物基因,,,,tsne,,,,FlowWorkspace,,,,细胞瘤,,,,XML,,,,rcolorbrewer |
链接 | |
建议 | 生物使用 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://www.r-project.orghttp://dambi.ugent.be |
取决于我 | |
进口我 | 催化剂,,,,胞胎,,,,diffcyt,,,,flowspy,,,,Metacyto |
建议我 | hdcytodata |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | flowsom_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | flowsom_1.18.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | flowsom_1.18.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowsom |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/流量 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/flowsom/ |
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