FISHalyseR

DOI:10.18129 / B9.bioc.FISHalyseR

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅FISHalyseR。

FISHalyseR自动化鱼量化的方案

Bioconductor版本:3.10

FISHalyseR提供功能来处理和分析数字图像细胞培养,特别是量化鱼在核探测。此外,它提取每个核的空间位置以及每个探测使空间co-localisation分析。

作者:卡雷什Arunakirinathan < akaresh88 gmail.com >,安德烈亚斯Heindl <安德烈亚斯。在icr.ac.uk heindl >

维护人员:卡雷什Arunakirinathan < akaresh88 gmail.com >,安德烈亚斯Heindl <安德烈亚斯。在icr.ac.uk heindl >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“FISHalyseR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“FISHalyseR”)

PDF	R脚本	在R FISHAlyseR自动荧光原位杂交量化
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBiology,软件
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	EBImage,abind
进口
链接
建议	knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	FISHalyseR_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	FISHalyseR_1.20.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	FISHalyseR_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FISHalyseR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ FISHalyseR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/FISHalyseR/
包下载报告	下载数据