女性
doi：10.18129/b9.bioc.fem
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅女性。
识别功能性表观遗传模块
生物导体版本：3.10
FEM软件包对DNA甲基化和基因表达数据进行了系统级集成分析。它寻求与功能相关的基因模块，这些基因表现出差异启动子DNA甲基化和差异表达，其中假定启动子DNA甲基化与基因表达之间的逆关联。有关完整的详细信息，请参见Jiao等人的生物信息学2014。
作者：Andrew E. Teschendorff和Zhen Yang
维护者：Zhen Yang
引用（从r内，输入引用（“ fem”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ fem”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ fem”）
| R脚本 | FEM软件包对DNA甲基化和基因表达进行了系统级集成分析。它寻求与功能相关的基因模块，这些基因表现出差异启动子DNA甲基化和差异表达，其中假定启动子DNA甲基化与基因表达之间的逆关联。有关完整的详细信息，请参见Jiao等人的生物信息学2014。 | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 差异性，，，，差甲基化，，，，NetworkEnrichment，，，，软件，，，，系统生物学 |
| 版本 | 3.14.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.0（R-3.1）（5。5年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | AnnotationDbi，，，，矩阵，，，，Marray，，，，Corrplot，，，，Igraph，，，，算，，，，林玛，，，，org.hs.eg.db，，，，图形，，，，生物基因 |
| 进口 | 图形 |
| 链接 | |
| 建议 | |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | 冠军 |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | fem_3.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | fem_3.14.0.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | FEM_3.14.0.TGZ |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fem |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/fem |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/fem/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
