此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅女性。
生物导体版本:3.10
FEM软件包对DNA甲基化和基因表达数据进行了系统级集成分析。它寻求与功能相关的基因模块,这些基因表现出差异启动子DNA甲基化和差异表达,其中假定启动子DNA甲基化与基因表达之间的逆关联。有关完整的详细信息,请参见Jiao等人的生物信息学2014。
作者:Andrew E. Teschendorff和Zhen Yang
维护者:Zhen Yang
引用(从r内,输入引用(“ fem”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ fem”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ fem”)
R脚本 | FEM软件包对DNA甲基化和基因表达进行了系统级集成分析。它寻求与功能相关的基因模块,这些基因表现出差异启动子DNA甲基化和差异表达,其中假定启动子DNA甲基化与基因表达之间的逆关联。有关完整的详细信息,请参见Jiao等人的生物信息学2014。 | |
参考手册 |
生物浏览 | 差异性,,,,差甲基化,,,,NetworkEnrichment,,,,软件,,,,系统生物学 |
版本 | 3.14.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.0(R-3.1)(5。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | AnnotationDbi,,,,矩阵,,,,Marray,,,,Corrplot,,,,Igraph,,,,算,,,,林玛,,,,org.hs.eg.db,,,,图形,,,,生物基因 |
进口 | 图形 |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | 冠军 |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | fem_3.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | fem_3.14.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | FEM_3.14.0.TGZ |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fem |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/fem |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/fem/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |