EBSeqHMM

DOI:10.18129 / B9.bioc.EBSeqHMM

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见EBSeqHMM．

在有序RNA-seq实验中识别基因或异构体表达变化的贝叶斯分析

Bioconductor版本:3.10

EBSeqHMM包实现了用于有序RNA-seq实验(例如时间过程或空间过程数据)统计分析的自回归隐马尔可夫模型。EBSeqHMM包提供了识别在时间点/位置上具有非恒定表达谱的基因和异构体的功能，并将它们聚类到表达路径中。

作者:宁冷，Christina Kendziorski

维护人员:Ning Leng

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("EBSeqHMM")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“EBSeqHMM”)

PDF	R脚本	嗯
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	贝叶斯，DifferentialExpression，GeneExpression，HiddenMarkovModel，ImmunoOncology，MultipleComparison，RNASeq，测序，软件，StatisticalMethod，TimeCourse
版本	1.20.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(5.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	EBSeq
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
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全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

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源包	EBSeqHMM_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	EBSeqHMM_1.20.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	EBSeqHMM_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EBSeqHMM
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/EBSeqHMM
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/EBSeqHMM/
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