此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见EBImage.
Bioconductor版本:3.10
EBImage为图像处理和分析提供了通用功能。在基于(高通量)显微镜的细胞分析的背景下,EBImage提供了分割细胞和提取定量细胞描述符的工具。这允许使用R编程语言自动化这些任务,并促进R环境中其他工具的使用,用于信号处理、统计建模、机器学习和图像数据可视化。
作者:Andrzej oleovic, Gregoire Pau, Mike Smith, Oleg Sklyar, Wolfgang Huber, Joseph Barry和Philip A. Marais贡献
维护者:Andrzej oleovich < Andrzej。在embl.de>的ole
引文(从R内,输入引用(“EBImage”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("EBImage")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“EBImage”)
超文本标记语言 | R脚本 | EBImage简介 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 软件,可视化 |
版本 | 4.28.1 |
在Bioconductor | BioC 1.8 (R-2.3)(14年) |
许可证 | LGPL |
取决于 | 方法 |
进口 | BiocGenerics(>= 0.7.1),图形,grDevices, stats,abind,tiff,jpeg,png,locfit,fftwtools(>= 0.9-7), utils,htmltools,htmlwidgets,RCurl |
链接 | |
建议 | BiocStyle,消化,knitr,rmarkdown,闪亮的 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/aoles/EBImage |
BugReports | https://github.com/aoles/EBImage/issues |
全靠我 | 红衣主教,CRImage,DonaPLLP2013,FISHalyseR,flowcatchR,furrowSeg,HD2013SGI,imageHTS |
进口我 | bnbc,承认,flowCHIC,的热图,MaxContrastProjection,寄居,山药 |
建议我 | DmelSGI,HilbertVis,tofsims |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | EBImage_4.28.1.tar.gz |
Windows二进制 | EBImage_4.28.1.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | EBImage_4.28.1.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EBImage |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/EBImage |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/EBImage/ |
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