EBImage

DOI:10.18129 / B9.bioc.EBImage

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见EBImage

图像处理和分析工具箱R

Bioconductor版本:3.10

EBImage为图像处理和分析提供了通用功能。在基于(高通量)显微镜的细胞分析的背景下,EBImage提供了分割细胞和提取定量细胞描述符的工具。这允许使用R编程语言自动化这些任务,并促进R环境中其他工具的使用,用于信号处理、统计建模、机器学习和图像数据可视化。

作者:Andrzej oleovic, Gregoire Pau, Mike Smith, Oleg Sklyar, Wolfgang Huber, Joseph Barry和Philip A. Marais贡献

维护者:Andrzej oleovich < Andrzej。在embl.de>的ole

引文(从R内,输入引用(“EBImage”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("EBImage")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“EBImage”)

超文本标记语言 R脚本 EBImage简介
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 软件可视化
版本 4.28.1
在Bioconductor BioC 1.8 (R-2.3)(14年)
许可证 LGPL
取决于 方法
进口 BiocGenerics(>= 0.7.1),图形,grDevices, stats,abindtiffjpegpnglocfitfftwtools(>= 0.9-7), utils,htmltoolshtmlwidgetsRCurl
链接
建议 BiocStyle消化knitrrmarkdown闪亮的
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/aoles/EBImage
BugReports https://github.com/aoles/EBImage/issues
全靠我 红衣主教CRImageDonaPLLP2013FISHalyseRflowcatchRfurrowSegHD2013SGIimageHTS
进口我 bnbc承认flowCHIC的热图MaxContrastProjection寄居山药
建议我 DmelSGIHilbertVistofsims
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 EBImage_4.28.1.tar.gz
Windows二进制 EBImage_4.28.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) EBImage_4.28.1.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EBImage
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/EBImage
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/EBImage/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网