Dupchecker
doi：10.18129/b9.bioc.dupchecker
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅Dupchecker。
用于检查荟萃分析中高通量基因组冗余的软件包
生物导体版本：3.10
荟萃分析已成为高通量基因组数据分析的流行方法，因为它通常可以显着增加检测数据集中生物信号或模式的功率。但是，当使用公共可用数据库进行荟萃分析时，样本的重复是经常遇到的问题，尤其是对于基因表达数据而言。不删除重复物会使研究结果值得怀疑。我们开发了一个生物处理程序套件DUPCHECKER，该包装可以通过生成用于原始数据的MD5指纹来有效地识别重复的样品。
作者：Quanhu Sheng，Yu Shyr，XI Chen
维护者：“ Quanhu Sheng”
引用（从r内，输入引用（“ dupchecker”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ dupchecker”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ dupchecker”）
| R脚本 | 使用“ Dupchecker”软件包验证基因组数据 | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 预处理，，，，软件 |
| 版本 | 1.24.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.0（R-3.1）（5。5年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | |
| 进口 | 工具，r.utils，，，，rcurl |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | dupchecker_1.24.0.tar.gz |
| Windows二进制 | dupchecker_1.24.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | dupchecker_1.24.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dupchecker |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/dupchecker |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/dupchecker/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
