Doscheda

DOI:10.18129 / B9.bioc.Doscheda

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅Doscheda。

下游Chemo-Proteomics分析管道

Bioconductor版本:3.10

Doscheda侧重于定量chemoproteomics用于确定蛋白相互作用的小分子从整个细胞或组织溶解产物使用质谱数据。包提供了一个闪亮的应用程序运行的管道,几可视图和一个可下载的实验报告。

作者:Bruno Contrino皮耶罗Ricchiuto

维护人员:布鲁诺Contrino < br1contrino在yahoo.co.uk >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“Doscheda”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“Doscheda”)

HTML	R脚本	Doscheda
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,MassSpectrometry,归一化,预处理,蛋白质组学,质量控制,回归,软件
版本	1.8.1
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.6)
进口	方法,刚果民主共和国统计数据,httr,jsonlite,reshape2,vsn,affy,limma,stringr,ggplot2、图形、grDevices校准,corrgram,gridExtra,DT,闪亮的,shinydashboard,readxl,d3heatmap,prodlim,matrixStats
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	Doscheda_1.8.1.tar.gz
Windows二进制	Doscheda_1.8.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	Doscheda_1.8.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Doscheda
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Doscheda
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Doscheda/
包下载报告	下载数据