此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅DSS。
生物导体版本:3.10
DSS是一个R库,对基于计数的测序数据进行不同的分析。它从RNA-Seq检测到差异表达的基因(DEG),并从甲基化的基因座或区域(DML/DMR)中检测到亚硫酸盐测序(BS-SEQ)。DSS的核心是一种新的分散收缩方法,用于估算γ-波森或β-二比分布的分散参数。
作者:hao wu
维护者:hao wu
引用(从r内,输入引用(“ DSS”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ dss”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ DSS”)
html | R脚本 | DSS用户指南 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | DNAMETHYLATY,,,,差异性,,,,差甲基化,,,,基因表达,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 2.34.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.11(R-2.15)(7。5年) |
执照 | GPL |
要看 | r(> = 3.3),生物酶,,,,BSSEQ,花键,方法 |
进口 | 统计,图形,延迟 |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | dmrcate,,,,亲,,,,Methcp |
建议我 | 饼干,,,,Methrix,,,,恰当的 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | dss_2.34.0.tar.gz |
Windows二进制 | dss_2.34.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | dss_2.34.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dss |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/dss |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/dss/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |