DSS

doi:10.18129/b9.bioc.dss

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅DSS

测序数据的分散收缩

生物导体版本:3.10

DSS是一个R库,对基于计数的测序数据进行不同的分析。它从RNA-Seq检测到差异表达的基因(DEG),并从甲基化的基因座或区域(DML/DMR)中检测到亚硫酸盐测序(BS-SEQ)。DSS的核心是一种新的分散收缩方法,用于估算γ-波森或β-二比分布的分散参数。

作者:hao wu

维护者:hao wu

引用(从r内,输入引用(“ DSS”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ dss”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ DSS”)

html R脚本 DSS用户指南
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 DNAMETHYLATY,,,,差异性,,,,差甲基化,,,,基因表达,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件
版本 2.34.0
在生物导体中 Bioc 2.11(R-2.15)(7。5年)
执照 GPL
要看 r(> = 3.3),生物酶,,,,BSSEQ,花键,方法
进口 统计,图形,延迟
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我 dmrcate,,,,,,,,Methcp
建议我 饼干,,,,Methrix,,,,恰当的
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 dss_2.34.0.tar.gz
Windows二进制 dss_2.34.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) dss_2.34.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dss
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/dss
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/dss/
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