DNABarcodes

DOI:10.18129 / B9.bioc.DNABarcodes

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见DNABarcodes．

用于创建和分析用于下一代测序多路复用实验的DNA条形码的工具

Bioconductor版本:3.10

该软件包提供了创建DNA条形码集的功能，能够纠正插入、删除和替换错误。现有的条形码可以根据条形码之间的最小、最大和平均距离进行分析。最后，以一个(可能是突变的)条形码开始的读取可以被解复用，即分配给它们原始的参考条形码。

作者:Tilo Buschmann < Tilo . Buschmann。在gmail.com>交流

维护者:Tilo Buschmann < Tilo . Buschmann。在gmail.com>交流

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("DNABarcodes")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“DNABarcodes”)

超文本标记语言	R脚本	DNABarcodes
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	预处理，测序，软件
版本	1.16.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(4.5年)
许可证	GPL-2
取决于	矩阵、并行
进口	Rcpp(> = 0.11.2),黑洞
链接	Rcpp，黑洞
建议	knitr，BiocStyle，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	DNABarcodeCompatibility
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	DNABarcodes_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	DNABarcodes_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	DNABarcodes_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DNABarcodes
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DNABarcodes
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DNABarcodes/
软件包下载报告	下载数据