DEScan2

DOI:10.18129 / B9.bioc.DEScan2

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅DEScan2。

微分浓缩扫描2

Bioconductor版本:3.10

集成的峰值和微分调用者,专门为广泛的外遗传性的信号。

作者:达里奥Righelli (aut (cre),约翰Koberstein (aut),布鲁斯·戈梅斯(aut),南希·张(aut),克劳迪娅Angelini (aut),露西娅Peixoto (aut),大卫。Risso (aut)

维护人员:达里奥Righelli <达里奥。在gmail.com righelli >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“DEScan2”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“DEScan2”)

HTML	R脚本	DEScan2装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	报道,表观遗传学,ImmunoOncology,PeakDetection,测序,软件
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(2年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5),GenomicRanges
进口	BiocParallel,BiocGenerics,ChIPpeakAnno,data.table,DelayedArray,GenomeInfoDb,GenomicAlignments,胶水,IRanges,plyr,Rcpp(> = 0.12.13),rtracklayer,S4Vectors(> = 0.23.19),SummarizedExperiment、工具、跑龙套
链接	Rcpp,RcppArmadillo
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat,刨边机,limma,EDASeq,RUVSeq,RColorBrewer,statmod
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	DEScan2_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	DEScan2_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	DEScan2_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DEScan2
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DEScan2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DEScan2/
包下载报告	下载数据