此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见反编排.
Bioconductor版本:3.10
差异基因表达分析工具使用的不同数据格式之间的转换。
作者:Andrzej oleych
维护者:Andrzej oleovich < Andrzej。在embl.de>的ole
引文(从R内,输入引用(“反编排”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("DEFormats")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“反编排”)
超文本标记语言 | R脚本 | 差异基因表达数据格式转换器 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,GeneExpression,ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件,转录 |
版本 | 1.14.0 |
在Bioconductor | BioC 3.3 (R-3.3)(4年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | |
进口 | 使彻底失败,data.table,DESeq2,刨边机(> = 3.13.4),GenomicRanges、方法、S4Vectors统计数据,SummarizedExperiment |
链接 | |
建议 | BiocStyle(> = 1.8.0),knitr,rmarkdown,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/aoles/DEFormats |
BugReports | https://github.com/aoles/DEFormats/issues |
全靠我 | |
进口我 | regionReport |
建议我 | 理想的 |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | DEFormats_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | DEFormats_1.14.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | DEFormats_1.14.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DEFormats |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DEFormats |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/DEFormats/ |
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