此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见DAPAR.
Bioconductor版本:3.10
这个包包含了蛋白质组数据可视化和统计分析的功能集合。
作者:Samuel Wieczorek [cre,aut], Florence Combes [aut], Thomas Burger [aut], Cosmin Lazar [ctb], Alexia Dorffer [ctb]
维护者:Samuel Wieczorek < Samuel。wieczorek在cea.fr >
引用(从R中,输入引用(“DAPAR”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("DAPAR")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“DAPAR”)
R脚本 | Prostar用户手册 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,去,MassSpectrometry,归一化,预处理,蛋白质组学,质量控制,软件 |
版本 | 1.18.5 |
Bioconductor自 | BioC 3.2 (R-3.2)(4.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 3.6.1),foreach平行,doParallel,igraph |
进口 | MSnbase,RColorBrewer统计数据,preprocessCore,开罗,png,晶格,reshape2,gplots,pcaMethods,ggplot2,limma,knitr,tmvtnorm,规范,嫁祸于,stringrgrDevices图形,openxlsx跑龙套,cp4p(> = 0.3.5),尺度,矩阵,vioplot,imp4p(> = 0.8),highcharter(> = 0.7.0),DAPARdata(> = 1.16.0),siggenes,图,lme4,readxl,clusterProfiler,dplyr,tidyr,AnnotationDbi,vsn,FactoMineR,factoextra,visNetwork |
链接 | |
建议 | BiocGenerics,Biobase,testthat,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | Prostar |
建议我 | DAPARdata |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | DAPAR_1.18.5.tar.gz |
Windows二进制 | DAPAR_1.18.5.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | DAPAR_1.18.5.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DAPAR |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DAPAR |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/DAPAR/ |
包下载报告 | 下载数据 |