CytoML

DOI:10.18129 / B9.bioc.CytoML

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见CytoML．

跨平台细胞检测数据共享的GatingML接口

Bioconductor版本:3.10

使用GatingML2.0标准的特定平台实现与其他软件平台交换门控细胞术数据。

作者:Mike Jiang, J. Spidlen。，N. Gopalakrishnan, F. Hahne, B. Ellis, R. Gentleman, M. Dalphin, N. Le Meur, B. Purcell

维护者:Mike Jiang

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("巨细胞")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“CytoML”)

超文本标记语言	R脚本	如何导出一个GatingSet到GatingML
超文本标记语言	R脚本	如何将Cytobank导入GatingSet
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，DataRepresentation，FlowCytometry，ImmunoOncology，软件
版本	1.12.1
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(3.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	flowCore(> = 1.43.10),flowWorkspace(> = 3.33.10),openCyto(> = 1.11.3),XML，data.table，jsonlite，RBGL，ncdfFlow，Rgraphviz，Biobase、方法、图，图形，utils，base64enc，plyr，dplyr， grDevices，方法，ggcyto(> = 1.11.4),yaml，晶格统计数据,corpcor，RUnit
链接	Rcpp，黑洞(> = 1.62.0-1),RProtoBufLib(> = 1.3.7),cytolib(> = 1.3.3),RcppParallel
建议	testthat，flowWorkspaceData(> = 2.11.1),knitr、并行
SystemRequirements	xml2, GNU make, c++ 11
增强了
URL	https://github.com/RGLab/CytoML
BugReports	https://github.com/RGLab/CytoML/issues
全靠我
进口我	FlowSOM
建议我	flowWorkspace，openCyto
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	CytoML_1.12.1.tar.gz
Windows二进制	CytoML_1.12.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	CytoML_1.12.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CytoML
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/巨细胞
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CytoML/
软件包下载报告	下载数据