CrossICC

DOI:10.18129 / B9.bioc.CrossICC

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅CrossICC。

一个交互式共识集群多平台数据分析框架

Bioconductor版本:3.10

CrossICC利用迭代策略最优基因和集群数量设置来自相似矩阵生成的共识一致聚类,它能够处理多个跨平台的数据集,这样不需要between-dataset的标准化。这个包还提供了丰富的功能可视化和识别癌症亚型。特别,许多癌症相关分析方法嵌入促进癌症亚型的临床翻译确认。

作者:于太阳(aut (cre)齐赵(aut)

维修工:于太阳< suny226 mail2.sysu.edu.cn >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“CrossICC”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“CrossICC”)

HTML	R脚本	如何使用CrossICC吗?
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	BatchEffect,分类,聚类,DifferentialExpression,FeatureExtraction,GUI,GeneExpression,GeneSetEnrichment,微阵列,归一化,预处理,RNASeq,软件,生存,可视化
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (r - 3.6)(< 6个月)
许可证	GPL-3 |文件许可证
取决于	R (> = 3.5),质量
进口	data.table、方法、MergeMaid,ConsensusClusterPlus,limma,集群,dplyr,BiobasegrDevices,统计数据、图形、跑龙套
链接
建议	rmarkdown,testthat,knitr,闪亮的,shinydashboard,shinyWidgets,shinycssloaders,DT,ggthemes,ggplot2,pheatmap,RColorBrewer,宠物猫,ggalluvial
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	CrossICC_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	CrossICC_1.0.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	CrossICC_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CrossICC
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CrossICC
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CrossICC/
包下载报告	下载数据