countblust.

DOI：10.18129 / b9.bioc.countlust.

此套餐适用于Biocumonds 3.10版;对于稳定的最新版本版本，请参阅countblust.。

使用成员模型等级聚类和可视化RNA-SEQ表达数据

生物导体版本：3.10

适用于群集RNA-SEQ基因表达计数数据的成员模型（GOM，也称为混合物模型）的等级，识别驾驶集群成员资格的特征基因，并提供集群成员资格的视觉摘要。

作者：Kushal Dey [Aut，Cre]，Joyce Hsiao [Aut]，Matthew Stephens [Aut]

维护者：苏克西哥的Kushal Dey

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“3.6”）并输入：

if（！perceneNamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“countclust”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

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BROWSEVIGNETTES（“COUNTCLUST”）

HTML.	r script.	小插图标题
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文本		消息

细节

Biocviews.	聚类那基因表达那免疫学那rnaseq.那测序那软件那统计方法那可视化
版本	1.14.0
在生物导体中以来	BIOC 3.3（R-3.3）（4年）
执照	GPL（> = 2）
依靠	r（> = 3.4），ggplot2.（> = 2.1.0）
进口	Squarem.那sl，maptpx，普利尔（> = 1.7.1），电台那GTOOLS.那FlexMix.那野餐那林马， 平行，重塑2.，统计，utils，图形，grdevices
链接到
建议	kn那kableextra那生物焦那BioBase.那Roxygen2.那rcolorbrewer.那devtools.那xtable.
系统要求
加强
URL.	https://github.com/kkdey/countlust.
取决于我
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建议我
链接给我
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包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	countclust_1.14.0.tar.gz.
Windows二进制文件	countclust_1.14.0.zip.（32-＆64位）
Mac OS x 10.11（El Capitan）	countclust_1.14.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/countlust.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包装/ countlust
包短网址	https://biocumon.org/packages/countclust/
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