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CopyNumberPlots
DOI:10.18129 / B9.bioc.CopyNumberPlots
此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见CopyNumberPlots．
使用核ploter功能创建复制数图
Bioconductor版本:3.10
copynumberplot具有一组扩展了核型图功能的函数，可以创建漂亮的、可定制的、灵活的复制数相关数据图。
作者:Bernat Gel
维护器:Bernat Gel
引用(从R中，输入引用(“CopyNumberPlots”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:
browseVignettes(“CopyNumberPlots”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | CopyNumberPlots装饰图案 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | CopyNumberVariation，报道，DNASeq，DataImport，OneChannel，测序，软件，可视化 |
| 版本 | 1.2.3 |
| Bioconductor自 | BioC 3.9 (R-3.6)(1年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 3.6),karyoploteR |
| 进口 | 地区，IRanges，Rsamtools，SummarizedExperiment，VariantAnnotation、方法、统计数据GenomeInfoDb，GenomicRanges，cn.mops，rhdf5,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，knitr，panelcn.mops，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked，DNAcopy，testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/bernatgel/CopyNumberPlots |
| BugReports | https://github.com/bernatgel/CopyNumberPlots/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | CNVfilteR |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | CopyNumberPlots_1.2.3.tar.gz |
| Windows二进制 | CopyNumberPlots_1.2.3.zip |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | CopyNumberPlots_1.2.3.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CopyNumberPlots |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CopyNumberPlots |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CopyNumberPlots/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
