ComplexHeatmap

DOI:10.18129 / B9.bioc.ComplexHeatmap

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见ComplexHeatmap

制作复杂的热图

Bioconductor版本:3.10

复杂的热图可以有效地可视化不同来源的数据集之间的关联,并揭示潜在的模式。这里,ComplexHeatmap包提供了一种高度灵活的方式来安排多个热图,并支持各种注释图形。

作者:顾祖光

维护者:祖光谷

引文(从R内,输入引用(“ComplexHeatmap”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("ComplexHeatmap")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“ComplexHeatmap”)

超文本标记语言 complex_heatmap.html
超文本标记语言 R脚本 最可能被问到的问题
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews 测序软件可视化
版本 2.2.0
在Bioconductor BioC 3.1 (R-3.2)(5年)
许可证 MIT +文件许可证
取决于 R(>= 3.1.2),方法,网格,图形,统计,grDevices
进口 circlize(> = 0.4.5),GetoptLong色彩线索RColorBrewerGlobalOptions(>= 0.1.0),平行,png
链接
建议 testthat(> = 1.0.0),knitr减价dendsort开罗jpegtifffastclusterdendextend(> = 1.0.1),grImportgrImport2胶水GenomicRanges
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/jokergoo/ComplexHeatmaphttps://jokergoo.github.io/ComplexHeatmap-reference/book/
全靠我 意大利苦杏酒EnrichedHeatmap收回
进口我 artMSBiocOncoTKblacksheepr催化剂可可可乐DEComplexDiseaseDEGreportdiffcyt埃尔默EnrichmentBrowserfCCACImpulseDE2LineagePulse马斯喀特MWASToolsPathoStatprofileplyrSEtoolssingleCellTKTCGAWorkflowXevaYAPSA
建议我 阿尔卑斯山脉gtrellisHilbertCurveprojectRTCGAbiolinksTCGAutilsTimeSeriesExperiment
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 ComplexHeatmap_2.2.0.tar.gz
Windows二进制 ComplexHeatmap_2.2.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) ComplexHeatmap_2.2.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ComplexHeatmap
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ComplexHeatmap
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ComplexHeatmap/
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