此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见ComplexHeatmap.
Bioconductor版本:3.10
复杂的热图可以有效地可视化不同来源的数据集之间的关联,并揭示潜在的模式。这里,ComplexHeatmap包提供了一种高度灵活的方式来安排多个热图,并支持各种注释图形。
作者:顾祖光
维护者:祖光谷
引文(从R内,输入引用(“ComplexHeatmap”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("ComplexHeatmap")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“ComplexHeatmap”)
超文本标记语言 | complex_heatmap.html | |
超文本标记语言 | R脚本 | 最可能被问到的问题 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | 测序,软件,可视化 |
版本 | 2.2.0 |
在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(5年) |
许可证 | MIT +文件许可证 |
取决于 | R(>= 3.1.2),方法,网格,图形,统计,grDevices |
进口 | circlize(> = 0.4.5),GetoptLong,色彩,线索,RColorBrewer,GlobalOptions(>= 0.1.0),平行,png |
链接 | |
建议 | testthat(> = 1.0.0),knitr,减价,dendsort,开罗,jpeg,tiff,fastcluster,dendextend(> = 1.0.1),grImport,grImport2,胶水,GenomicRanges |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/jokergoo/ComplexHeatmaphttps://jokergoo.github.io/ComplexHeatmap-reference/book/ |
全靠我 | 意大利苦杏酒,EnrichedHeatmap,收回 |
进口我 | artMS,BiocOncoTK,blacksheepr,催化剂,可可,可乐,DEComplexDisease,DEGreport,部,diffcyt,埃尔默,EnrichmentBrowser,fCCAC,ImpulseDE2,LineagePulse,马斯喀特,MWASTools,PathoStat,profileplyr,SEtools,singleCellTK,TCGAWorkflow,Xeva,YAPSA |
建议我 | 阿尔卑斯山脉,gtrellis,HilbertCurve,projectR,TCGAbiolinks,TCGAutils,TimeSeriesExperiment |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | ComplexHeatmap_2.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | ComplexHeatmap_2.2.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | ComplexHeatmap_2.2.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ComplexHeatmap |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ComplexHeatmap |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ComplexHeatmap/ |
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