compgo
doi：10.18129/b9.bioc.compgo
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅compgo。
用于.bed文件注释的r管道，比较基因集与数据可视化之间的GO期限富集
生物导体版本：3.10
该软件包包含完成多个任务的功能。它能够从UCSC下载完整的基因组数据库，轻松地导入文件，以上述数据库转储的基因（加距离）的基因（加距离）注释这些.bed文件区域，与David接口，以创建功能注释和基因本体论图表，并基于基因浓度列表（例如从输入.bed文件生成的），最后使用有向的无环形图或散点图可视化和比较这些富集。
作者：Sam D. Bassett [AUT]，Ashley J. Waardenberg [AUT，CRE]
维护者：Ashley J. Waardenberg
引用（从r内，输入引用（“ compgo”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ compgo”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ compgo”）
| R脚本 | 介绍 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 去，，，，基因烯，，，，多重组合，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 1.22.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.14（R-3.1）（6年） |
| 执照 | GPL-2 |
| 要看 | rdavidwebservice |
| 进口 | rtracklayer，，，，rgraphviz，，，，GGPLOT2，，，，GenomicFeatures，，，，txdb.mmusculus.ucsc.mm9，，，，pcamethods，，，，RESHAPE2，，，，PathView |
| 链接 | |
| 建议 | |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | compgo_1.22.0.tar.gz |
| Windows二进制 | compgo_1.22.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | compgo_1.22.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/compgo |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/compgo |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/compgo/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
