ClassifyR

DOI:10.18129 / B9.bioc.ClassifyR

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见ClassifyR

交叉验证分类问题的框架,应用于差异可变性和差异分布测试

Bioconductor版本:3.10

该软件在r中形成了一个分类框架。数据转换,特征选择,分类器训练和预测。变量类型和名称的要求是固定的,但也可以为函数提供专门的变量。分类框架被包裹在一个驱动程序循环中,该循环可重复地执行许多交叉验证方案。函数微分表达式,微分可变性,微分分布包括在内。用户可以通过创建到框架的接口来开发其他功能。

作者:Dario Strbenac, John Ormerod, Graham Mann, Jean Yang

维护者:Dario Strbenac < Dario。Strbenac网址:syney.edu.au>

引文(从R内,输入引用(“ClassifyR”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("ClassifyR")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“ClassifyR”)

超文本标记语言 R脚本 ClassifyR包简介
超文本标记语言 R脚本 示例:为k-NN分类器创建一个包装函数
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 分类软件生存
版本 2.6.1
在Bioconductor BioC 3.0 (R-3.1)(5.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R(>= 3.5.0),方法,S4Vectors(> = 0.18.0),MultiAssayExperiment(> = 1.6.0),BiocParallel
进口 locfit,网格,utils,plyr
链接
建议 limmagenefilter刨边机Rmixmodggplot2(> = 3.0.0),gridExtra(> = 2.0.0),cowplotBiocStylepamrPoiClaCluparathyroidSEknitrhtmltoolsgtable尺度e1071rmarkdownIRangesrandomForestrobustbaseglmnet
SystemRequirements
增强了
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 ClassifyR_2.6.1.tar.gz
Windows二进制 ClassifyR_2.5.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) ClassifyR_2.6.1.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ClassifyR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ClassifyR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ClassifyR/
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