ChromheatMap

doi:10.18129/b9.bioc.chromheatmap

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅ChromheatMap

基因组坐标的热图绘图

生物导体版本:3.10

ChromheatMap封装可用于沿给定染色体的每个链作为热图绘制全基因组的数据(例如表达,CGH,SNP)。生成的热图可用于交互式识别感兴趣的探针和基因。

作者:蒂姆·雷纳(Tim F. Rayner)

维护者:蒂姆·雷纳(Tim F. Rayner)

引用(从r内,输入引用(“ ChromheatMap”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ chromheatmap”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ ChromheatMap”)

PDF R脚本 用ChromheatMap绘制表达数据
PDF 参考手册

细节

生物浏览 软件,,,,可视化
版本 1.40.0
在生物导体中 Bioc 2.5(R-2.10)(10。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 2.9.0),生物基因(> = 0.3.2),注释(> = 1.20.0),AnnotationDbi(> = 1.4.0)
进口 生物酶(> = 2.17.8),图形,grdevices,方法,统计,iranges,,,,rtracklayer,,,,基因组机
链接
建议 全部,,,,HGU95AV2.DB
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 chromheatmap_1.40.0.tar.gz
Windows二进制 chromheatmap_1.40.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) chromheatmap_1.40.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chromheatmap
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/chromheatmap
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/chromheatmap/
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