芝加哥

DOI:10.18129 / B9.bioc.Chicago

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅芝加哥。

芝加哥:捕捉高c基因组组织的分析

Bioconductor版本:3.10

分析获取高c数据的管道。

作者:乔纳森·凯恩斯Paula Freire普里切特,史蒂文Wingett,米哈伊尔•Spivakov

维修工:米哈伊尔Spivakov <米哈伊尔。在lms.mrc.ac.uk spivakov >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(《芝加哥》)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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HTML	R脚本	芝加哥的故事
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文本		新闻

细节

biocViews	表观遗传学,嗝,测序,软件
版本	1.14.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(4年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.2),data.table
进口	matrixStats,质量,Hmisc,Delaporte、方法、grDevices图形、统计、跑龙套
链接
建议	argparse,BiocStyle,knitr,rmarkdown,PCHiCdata,testthat,Rsamtools,GenomicInteractions,GenomicRanges,IRanges,AnnotationHub
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	PCHiCdata
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	Chicago_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	Chicago_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	Chicago_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Chicago
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/芝加哥
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Chicago/
包下载报告	下载数据