此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅芯片。
生物导体版本:3.10
芯片序列数据模拟的一般框架。尽管目前专注于核小体定位,但包装旨在支持不同类型的实验。
作者:彼得·洪堡(Peter Humburg)
维护者:彼得·洪堡(Peter Humburg)
引用(从r内,输入引用(“芯片”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ chipsim”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“芯片”)
R脚本 | 模拟CHIP-SEQ实验 | |
参考手册 |
生物浏览 | chipseq,,,,基础设施,,,,软件 |
版本 | 1.40.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.5(R-2.10)(10。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | 生物弦(> = 2.29.2) |
进口 | iranges,,,,xvector,,,,生物弦,,,,Shortread,图形,方法,统计,utils |
链接 | |
建议 | 算术,,,,动物园 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | chipsim_1.40.0.tar.gz |
Windows二进制 | chipsim_1.40.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | chipsim_1.40.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chipsim |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/芯片 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/chipsim/ |
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