ChIPseqR

DOI:10.18129 / B9.bioc.ChIPseqR

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见ChIPseqR．

在高通量测序数据中识别蛋白质结合位点

Bioconductor版本:3.10

ChIPseqR从ChIP-seq和核小体定位实验中识别蛋白质结合位点。用来描述结合事件的模型是为了定位核小体而开发的，但应该足够灵活，可以处理其他类型的实验。

作者:Peter Humburg

维护者:Peter Humburg < Peter。Humburg在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("ChIPseqR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ChIPseqR”)

PDF	R脚本	ChIPseqR简介
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPSeq，基础设施，软件
版本	1.40.0
在Bioconductor	BioC 2.5 (R-2.10)(10.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R(>= 2.10.0)，方法，BiocGenerics，S4Vectors(> = 0.9.25)
进口	Biostrings，fBasics，GenomicRanges，IRanges(>= 2.5.14)，图形，grDevices，HilbertVis，ShortRead统计数据,timsac,跑龙套
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ChIPseqR_1.40.0.tar.gz
Windows二进制	ChIPseqR_1.40.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	ChIPseqR_1.40.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChIPseqR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ChIPseqR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ChIPseqR/
软件包下载报告	下载数据