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ChIPComp
DOI:10.18129 / B9.bioc.ChIPComp
这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ChIPComp。
定量的比较多个ChIP-seq数据集
Bioconductor版本:3.10
ChIPComp检测不同绑定锋利的结合位点在多个条件考虑匹配控制。
作者:吴皓李Chen,朝晖。秦,王气
维护人员:李陈<李。陈在emory.edu >
从内部引用(R,回车引用(“ChIPComp”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ChIPComp”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“ChIPComp”)
| R脚本 | ChIPComp | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | ChIPSeq,报道,DataImport,遗传学,MultipleComparison,测序,软件,转录 |
| 版本 | 1.16.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.2 (r - 3.2)(4.5年) |
| 许可证 | GPL |
| 取决于 | R (> = 3.2.0),GenomicRanges,IRanges,rtracklayer,GenomeInfoDb,S4Vectors |
| 进口 | Rsamtools,limma,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9,BiocGenerics |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,RUnit |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | ChIPComp_1.16.0.tar.gz |
| Windows二进制 | ChIPComp_1.16.0.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | ChIPComp_1.16.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChIPComp |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ChIPComp |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ChIPComp/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
