ChIPComp

DOI:10.18129 / B9.bioc.ChIPComp

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ChIPComp

定量的比较多个ChIP-seq数据集

Bioconductor版本:3.10

ChIPComp检测不同绑定锋利的结合位点在多个条件考虑匹配控制。

作者:吴皓李Chen,朝晖。秦,王气

维护人员:李陈<李。陈在emory.edu >

从内部引用(R,回车引用(“ChIPComp”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ChIPComp”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ChIPComp”)

PDF R脚本 ChIPComp
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ChIPSeq,报道,DataImport,遗传学,MultipleComparison,测序,软件,转录
版本 1.16.0
Bioconductor自 BioC 3.2 (r - 3.2)(4.5年)
许可证 GPL
取决于 R (> = 3.2.0),GenomicRanges,IRanges,rtracklayer,GenomeInfoDb,S4Vectors
进口 Rsamtools,limma,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9,BiocGenerics
链接
建议 BiocStyle,RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 ChIPComp_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 ChIPComp_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) ChIPComp_1.16.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChIPComp
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ChIPComp
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ChIPComp/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网