Cellnoptr
doi：10.18129/b9.bioc.cellnoptr
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅Cellnoptr。
使用先验知识网络和扰动数据培训信号网络的布尔逻辑模型
生物导体版本：3.10
该软件包可以根据先前的知识网络和网络中节点扰动的一组数据来优化信号通路的布尔逻辑网络。
作者：T.Cokelaer，F.eduati，A.Macnamara，S.Schrier，C.Terfve
维护者：a.gabor
引用（从r内，输入引用（“ cellnoptr”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ cellnoptr”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ cellnoptr”）
| cellnoptr0_1flowchart.pdf | ||
| 图2.pdf | ||
| 图3.pdf | ||
| 图4.pdf | ||
| 图6.pdf | ||
| 图7.pdf | ||
| 图8.pdf | ||
| R脚本 | 主要小插图：使用CellNoptr玩网络 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 生物信息学，，，，蜂窝基，，，，细胞生物学，，，，免疫学，，，，蛋白质组学，，，，软件，，，，时间科 |
| 版本 | 1.32.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.9（R-2.14）（8。5年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | r（> = 2.15.0），rbgl，，，，图形， 方法，哈希，，，，rcurl，，，，rgraphviz，，，，XML，，，，GGPLOT2 |
| 进口 | Igraph，，，，Stringi，，，，Stringr |
| 链接 | |
| 建议 | Data.Table，，，，plyr，，，，dplyr，，，，花花公子，，，，readr，，，，运行，，，，生物基因 |
| 系统要求 | GraphViz版本> = 2.2 |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | CNORDT，，，，cnorfeeder，，，，cnorfuzzy，，，，cnorode |
| 进口我 | |
| 建议我 | Meigor |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | cellnoptr_1.32.0.tar.gz |
| Windows二进制 | cellnoptr_1.32.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | cellnoptr_1.32.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cellnoptr |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/cellnoptr |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/cellnoptr/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
