CellMapper

DOI:10.18129 / B9.bioc.CellMapper

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅CellMapper。

预测基因选择性表达在特定的细胞类型

Bioconductor版本:3.10

推断细胞特定类型表达式基于co-expression相似性与已知的细胞类型标记基因。可以使用公开的表达数据做出准确的预测,即使细胞类型没有被孤立。

作者:布拉德那里提取

维修工:布拉德那里提取< bnelms。研究在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“CellMapper”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“CellMapper”)

PDF	R脚本	CellMapper装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,微阵列,软件
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(3.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	S4Vectors、方法
进口	统计,跑龙套
链接
建议	CellMapperData,Biobase,HumanAffyData,所有,BiocStyle,ExperimentHub
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	CellMapperData
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	CellMapper_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	CellMapper_1.12.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	CellMapper_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CellMapper
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CellMapper
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CellMapper/
包下载报告	下载数据