这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅CellBench。
Bioconductor版本:3.10
这个包包含基础设施为基准测试分析方法和访问单个细胞混合物基准数据。它提供了一个组织框架分析方法和测试方法的组合在一个没有明确的管道布置每个组合。它还提供了公用事业的采样和过滤SingleCellExperiment对象,构造函数具有不同的参数列表,多线程的评估分析方法。
作者:Shian Su (cre, aut], Saskia Freytag (aut) Luyi田(aut) Xueyi盾(aut),马修·里奇(aut)彼得·希[所有],斯图亚特·李(施)
维护人员:Shian <苏苏。年代在wehi.edu.au >
从内部引用(R,回车引用(“CellBench”)
):
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“CellBench”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“CellBench”)
R脚本 | 数据操作 | |
HTML | R脚本 | 介绍 |
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参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 基础设施,软件 |
版本 | 1.2.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.9 (r - 3.6)(1年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (> = 3.6),SingleCellExperiment,magrittr、方法、统计数据宠物猫,跑龙套 |
进口 | BiocFileCache,BiocParallel,dplyr,rlang,胶水,memoise,purrr(> = 0.3.0),rappdirs,tidyr,lubridate |
链接 | |
建议 | BiocStyle,covr,knitr,rmarkdown,testthat,limma,ggplot2 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/shians/cellbench |
BugReports | https://github.com/Shians/CellBench/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | CellBench_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | CellBench_1.2.0.zip |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | CellBench_1.2.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CellBench |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CellBench |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CellBench/ |
包下载报告 | 下载数据 |