此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见类别.
Bioconductor版本:3.10
用于执行类别(基因集富集)分析的工具集合。
作者:Robert Gentleman [aut], Seth Falcon [ctb], Deepayan Sarkar [ctb], Robert Castelo [ctb], Bioconductor Package Maintainer [cre]
维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>
引文(从R内,输入引用(“类别”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("Category")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“类别”)
R脚本 | 使用分类分析微阵列数据 | |
R脚本 | 以染色体带为分类 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 注释,去,GeneSetEnrichment,通路,软件 |
版本 | 2.52.1 |
在Bioconductor | BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 15年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | 方法、stats4BiocGenerics,AnnotationDbi,Biobase,矩阵 |
进口 | 跑龙套,统计数据,图,RBGL,GSEABase,genefilter,注释,DBI |
链接 | |
建议 | EBarrays,所有,Rgraphviz,RColorBrewer,xtable(> = 1.4 6),hgu95av2.db,KEGG.db,karyoploteR,geneplotter,limma,晶格,RUnit,org.Sc.sgd.db,GOstats,GO.db |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | GOstats,PCpheno |
进口我 | categoryCompare,cellHTS2,eisa,gCMAP,GmicR,interactiveDisplay,meshr,miRLAB,PCpheno,phenoTest,ppiStats,RDAVIDWebService,ReportingTools,scTensor |
建议我 | BiocCaseStudies,GSEAlm,MmPalateMiRNA,qpgraph,RnBeads |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | Category_2.52.1.tar.gz |
Windows二进制 | Category_2.52.1.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | Category_2.52.1.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Category |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Category |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Category/ |
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