类别

DOI:10.18129 / B9.bioc.Category

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见类别

类别分析

Bioconductor版本:3.10

用于执行类别(基因集富集)分析的工具集合。

作者:Robert Gentleman [aut], Seth Falcon [ctb], Deepayan Sarkar [ctb], Robert Castelo [ctb], Bioconductor Package Maintainer [cre]

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

引文(从R内,输入引用(“类别”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("Category")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“类别”)

PDF R脚本 使用分类分析微阵列数据
PDF R脚本 以染色体带为分类
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 注释GeneSetEnrichment通路软件
版本 2.52.1
在Bioconductor BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 15年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 方法、stats4BiocGenericsAnnotationDbiBiobase矩阵
进口 跑龙套,统计数据,RBGLGSEABasegenefilter注释DBI
链接
建议 EBarrays所有RgraphvizRColorBrewerxtable(> = 1.4 6),hgu95av2.dbKEGG.dbkaryoploteRgeneplotterlimma晶格RUnitorg.Sc.sgd.dbGOstatsGO.db
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 GOstatsPCpheno
进口我 categoryComparecellHTS2eisagCMAPGmicRinteractiveDisplaymeshrmiRLABPCphenophenoTestppiStatsRDAVIDWebServiceReportingToolsscTensor
建议我 BiocCaseStudiesGSEAlmMmPalateMiRNAqpgraphRnBeads
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 Category_2.52.1.tar.gz
Windows二进制 Category_2.52.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) Category_2.52.1.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Category
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Category
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/Category/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网