此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见红衣主教.
Bioconductor版本:3.10
实现用于分析质谱成像数据集的统计和计算工具,包括有效的预处理、空间分割和分类方法。
作者:Kylie A. Bemis
维护者:Kylie A. Bemis
引文(从R内,输入引用(“红衣主教”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("Cardinal")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“红衣主教”)
超文本标记语言 | R脚本 | 1.基数2:质谱成像分析用户指南 |
超文本标记语言 | R脚本 | 2.要点2:质谱成像的统计方法 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 分类,聚类,ImagingMassSpectrometry,ImmunoOncology,基础设施,Lipidomics,MassSpectrometry,归一化,蛋白质组学,回归,软件 |
版本 | 测试盒框 |
在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | BiocGenerics,BiocParallel,EBImage、图形、方法、S4Vectors(>= 0.23.18), stats,ProtGenerics |
进口 | Biobase,dplyr,irlba,晶格,矩阵,事,magrittr,mclust,nlme平行,信号,sp, stat4, utils,viridisLite |
链接 | |
建议 | BiocStyle,testthat,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.cardinalmsi.org |
全靠我 | CardinalWorkflows |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | Cardinal_2.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | Cardinal_2.4.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | Cardinal_2.4.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Cardinal |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Cardinal |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Cardinal/ |
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