CancerSubtypes

DOI:10.18129 / B9.bioc.CancerSubtypes

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅CancerSubtypes。

癌症亚型识别、验证和基于多个基因数据集的可视化

Bioconductor版本:3.10

CancerSubtypes集成了目前常见的计算生物学方法对癌症亚型识别和提供了一个标准化的框架对癌症亚型分析multi-omics数据,如基因表达,microrna的表达、DNA甲基化等。

作者:Taosheng徐< Taosheng。在gmail.com x >,Thuc Le

维护人员:徐Taosheng < Taosheng。在gmail.com x >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“CancerSubtypes”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“CancerSubtypes”)

HTML	R脚本	CancerSubtypes
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类,GeneExpression,软件,可视化
版本	1.12.1
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(3.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.4),sigclust,NMF
进口	SNFtool,iCluster,集群,嫁祸于,limma,ConsensusClusterPlusgrDevices,生存
链接
建议	BiocGenerics,RUnit,knitr,RTCGA.mRNA,RTCGA.clinical
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/taoshengxu/CancerSubtypes
BugReports	https://github.com/taoshengxu/CancerSubtypes/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	CancerSubtypes_1.12.1.tar.gz
Windows二进制	CancerSubtypes_1.12.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	CancerSubtypes_1.12.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CancerSubtypes
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CancerSubtypes
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CancerSubtypes/
包下载报告	下载数据