CTDquerier

DOI:10.18129 / B9.bioc.CTDquerier

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见CTDquerier．

用于CTDbase数据查询、可视化和下游分析

Bioconductor版本:3.10

从比较毒理学基因组学数据库(http://ctdbase.org/)检索和可视化数据的软件包。下载的数据被格式化为dataframe，用于进一步的下游分析。

作者:Carles Hernandez-Ferrer [aut, cre]， Jaun R. Gonzalez [aut]

维护者:Carles Hernandez-Ferrer < Carles。Hernandez在isglobal.org>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("CTDquerier")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“CTDquerier”)

超文本标记语言	R脚本	环境化学品与哮喘相关基因的个案研究
超文本标记语言	R脚本	ctdquerer:用于检索CTDbase数据以进行下游分析和数据可视化的包
超文本标记语言	R脚本	CTDquerier R包与CTDbase批量查询web工具的简单比较
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	BiomedicalInformatics，DataImport，DataRepresentation，去，GeneSetEnrichment，基础设施，KEGG，网络，NetworkEnrichment，通路，软件
版本	1.5.0
在Bioconductor	BioC 3.7 (R-3.5)(2年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.4.0)
进口	RCurl，stringr，S4Vectors，stringdist，ggplot2，igraph， utils，网格，gridExtra，方法，统计，BiocFileCache，rappdirs
链接
建议	BiocStyle，knitr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	CTDquerier_1.5.0.tar.gz
Windows二进制	CTDquerier_1.5.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	CTDquerier_1.5.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CTDquerier
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CTDquerier
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CTDquerier/
软件包下载报告	下载数据