CSAR
doi：10.18129/b9.bioc.csar
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅CSAR。
用于分析芯片序列数据的统计工具
生物导体版本：3.10
CHIP-SEQ数据分析的统计工具。该软件包包括Kaufmann等人中描述的统计方法。（2009）PLOS生物学：7（4）：E1000090。简而言之，该软件计算出基因组单核苷酸读取值的平均DNA片段大小。归一化后，使用基于泊松分布的测试比较样品和对照。测试统计阈值控制错误的发现率是通过随机排列获得的。
作者：Jose M Muino
维护者：Jose M Muino
引用（从r内，输入引用（“ CSAR”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ csar”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ CSAR”）
| R脚本 | CSAR VIGNETTE | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | chipseq，，，，遗传学，，，，软件，，，，转录 |
| 版本 | 1.38.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.6（R-2.11）（10年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 2.15.0），S4VECTORS，，，，iranges，，，，GenomeInfodB，，，，基因组机 |
| 进口 | 统计，utils |
| 链接 | |
| 建议 | Shortread，，，，生物弦 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 狭窄 |
| 建议我 | 狭窄 |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | csar_1.38.0.tar.gz |
| Windows二进制 | csar_1.38.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | csar_1.38.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/csar |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/csar |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/csar/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
