cnvfilter
doi：10.18129/b9.bioc.cnvfilter
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅cnvfilter。
通过使用SNV调用来识别CNV调用工具的误报
生物导体版本：3.10
CNVFILTER可以通过使用通常在通用NGS管道中获得的单个核苷酸变体（SNV）调用来识别可以丢弃的CNV。
作者：Igtp.cat>的Jose Marcos Moreno-Cabrera
维护者：jose marcos moreno-cabrera
引用（从r内，输入引用（“ cnvfilter”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ cnvfilter”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ cnvfilter”）
| html | R脚本 | CNVFILTER VIGNETTE |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 库务，，，，dnaseq，，，，DataImport，，，，测序，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 1.0.4 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.10（R-3.6）（<6个月） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | R（> = 3.6） |
| 进口 | iranges，，，，基因组机，，，，总结性特征，，，，pracma，，，，区域人，，，，断言，，，，核粒子，，，，库务，图形，utils，变体，，，，rsamtools，，，，GenomeInfodB，，，，生物弦， 方法 |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.masked |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/jpuntomarcos/cnvfilter |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | cnvfilter_1.0.4.4.tar.gz |
| Windows二进制 | cnvfilter_1.0.4.4.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | cnvfilter_1.0.4.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cnvfilter |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/cnvfilter |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/cnvfilter/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
